Nằm trong khu vực chuyển tiếp của châu Á và châu Úc, vườn quốc gia có chứa nhiều bộ sưu tập động vật độc đáo bao gồm khỉ đuôi dài Macaca, hồng hoàng Sulawesi, hồng hoàng nhăn Sulawesi, cầy cọ đảo Sulawesi, lợn rừng Malaysia, dơi. Gần đây vào tháng 3 năm 2008, nó đã được ghi nhận sự tồn tại của loài khỉ lùn tarsier Makassar,[5][6] và đặc biệt là loài cua nhện "Cancrocaeca chỉ có mặt duy nhất ở trong các hang động của vùng núi đá vôi Maros.[7][8]

Loài động vật nổi bật nhất của vườn quốc gia này là các loài bướm bao gồm các loài Cethosia myrana, bướm phượng cánh chim chấm liền, Troides hypolitus, Troides haliphron, Papilio peranthus. Nhà tự nhiên học người Anh Alfred Russel Wallace gọi địa điểm này là "vương quốc bướm".[9] Trong cuộc thám hiểm của mình vào năm 1857, Wallace đã tìm thấy 256 loài bướm, khác với báo cáo trước đó của Mattimu vào năm 1977, người đã tìm thấy 103 loài bướm bên trong vườn quốc gia với một số loài đặc hữu có thể kể đến là Papilio blumei, Papilio polytes, Papilio sataspes, và Graphium androcles.